ПАРАЛЛЕЛЬНАЯ РЕАЛИЗАЦИЯ МЕТОДА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА МНОГОЯДЕРНОМ ПРОЦЕССОРЕ
Аннотация
Предлагается методика распараллеливания пакета XMD молекулярной динамики на базе вычислительной системы с общей памятью. Выполняется параллельная реализация алгоритма молекулярной динамики в форме многопоточного Windows-приложения. Исследуется эффективность полученной реализации для моделирования ряда процессов в физике полупроводников на многоядерных компьютерах.
Об авторах
М. К. Буза
Белорусский государственный университет
Беларусь
Беларусь
О. М. Кондратьева
Белорусский государственный университет
Беларусь
Беларусь
Список литературы
1. XMD – Molecular Dynamics for Metals and Ceramics [Electronic resource]. – March, 2010. –
2. Mode of access : http://xmd.sourceforge.net/about.html. – Date of access : 01.09.2010.
3. Haile, J.M. Molecular Dynamics Simulation. Elementary Methods / J.M. Haile. – N.Y.,
4. Chichester, Brisbane, Toronto, Singapore : John Wiley & Sons Inc., 1992. – 490 p.
5. Highly optimized empirical potential model of silicon / T.J. Lenosky [et al.] // Modelling
6. Simul. Mater. Sci. Eng. – 2000. – Vol. 8. – P. 825–841.
7. LAMMPS Molecular Dynamics Simulator [Electronic resource]. – January, 2009. – Mode of
8. access : http://lammps.sandia.gov/. – Date of access : 01.09.2010.
9. The DL_POLY Molecular Simulation Project [Electronic resource]. – January, 2010. – Mode
10. of access : http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg/software/DL_POLY/. – Date of access : 01.09.2010.
11. The ITAP Molecular Dynamics Program [Electronic resource]. – March, 2010. – Mode of
12. access : http://www.itap.physik.uni-stuttgart.de/~imd/index.html. – Date of access : 01.09.2010.
13. Mishin, Y. Interatomic potentials for monoatomic metals from experimental data and ab initio calculations / Y. Mishin, D. Farkas // Phys. Rev. B. – 1999. – Vol. 59. – P. 3393–3407.
14. Plimpton, S. Fast Parallel Algorithms for Short-Range Molecular Dynamics / S. Plimpton //
15. Journal of Computational Physics. – 1995. – Vol. 117, № 1. – P. 1–19.
16. Smith, W. Molecular dynamics on hypercube parallel computer / W. Smith // Computer
17. Physics Communications. – 1991. – Vol. 62. – P. 229–248.
18. Рихтер, Дж. Windows для профессионалов: создание эффективных Win32-приложений
19. с учетом специфики 64-разрядной версии Windows / Дж. Рихтер. – СПб. : Питер, 2001. – 752 с.
Рецензия
Для цитирования:
Буза М.К., Кондратьева О.М. ПАРАЛЛЕЛЬНАЯ РЕАЛИЗАЦИЯ МЕТОДА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА МНОГОЯДЕРНОМ ПРОЦЕССОРЕ. Информатика. 2011;(1(29)):44-51.
Просмотров: 591
Послать статью по эл. почте 