informИнформатикаInformatics1816-03012617-6963UIIP NASBinform-379Research ArticleМАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕMATHEMATICAL MODELINGПАРАЛЛЕЛЬНАЯ РЕАЛИЗАЦИЯ МЕТОДА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА МНОГОЯДЕРНОМ ПРОЦЕССОРЕБузаМ. К.КондратьеваО. М.Белорусский государственный университетBelarus20112004201801(29)4451Copyright © Буза М.К., Кондратьева О.М., 20182018Буза М.К., Кондратьева О.М.Буза М.К., Кондратьева О.М.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://inf.grid.by/jour/article/view/379

Предлагается методика распараллеливания пакета XMD молекулярной динамики на базе вычислительной системы с общей памятью. Выполняется параллельная реализация алгоритма молекулярной динамики в форме многопоточного Windows-приложения. Исследуется эффективность полученной реализации для моделирования ряда процессов в физике полупроводников на многоядерных компьютерах.

ReferencesXMD – Molecular Dynamics for Metals and Ceramics [Electronic resource]. – March, 2010. –XMD – Molecular Dynamics for Metals and Ceramics [Electronic resource]. – March, 2010. –Mode of access : http://xmd.sourceforge.net/about.html. – Date of access : 01.09.2010.Mode of access : http://xmd.sourceforge.net/about.html. – Date of access : 01.09.2010.Haile, J.M. Molecular Dynamics Simulation. Elementary Methods / J.M. Haile. – N.Y.,Haile, J.M. Molecular Dynamics Simulation. Elementary Methods / J.M. Haile. – N.Y.,Chichester, Brisbane, Toronto, Singapore : John Wiley & Sons Inc., 1992. – 490 p.Chichester, Brisbane, Toronto, Singapore : John Wiley & Sons Inc., 1992. – 490 p.Highly optimized empirical potential model of silicon / T.J. Lenosky [et al.] // ModellingHighly optimized empirical potential model of silicon / T.J. Lenosky [et al.] // ModellingSimul. Mater. Sci. Eng. – 2000. – Vol. 8. – P. 825–841.Simul. Mater. Sci. Eng. – 2000. – Vol. 8. – P. 825–841.LAMMPS Molecular Dynamics Simulator [Electronic resource]. – January, 2009. – Mode ofLAMMPS Molecular Dynamics Simulator [Electronic resource]. – January, 2009. – Mode ofaccess : http://lammps.sandia.gov/. – Date of access : 01.09.2010.access : http://lammps.sandia.gov/. – Date of access : 01.09.2010.The DL_POLY Molecular Simulation Project [Electronic resource]. – January, 2010. – ModeThe DL_POLY Molecular Simulation Project [Electronic resource]. – January, 2010. – Modeof access : http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg/software/DL_POLY/. – Date of access : 01.09.2010.of access : http://www.cse.scitech.ac.uk/ccg/software/DL_POLY/. – Date of access : 01.09.2010.The ITAP Molecular Dynamics Program [Electronic resource]. – March, 2010. – Mode ofThe ITAP Molecular Dynamics Program [Electronic resource]. – March, 2010. – Mode ofaccess : http://www.itap.physik.uni-stuttgart.de/~imd/index.html. – Date of access : 01.09.2010.access : http://www.itap.physik.uni-stuttgart.de/~imd/index.html. – Date of access : 01.09.2010.Mishin, Y. Interatomic potentials for monoatomic metals from experimental data and ab initio calculations / Y. Mishin, D. Farkas // Phys. Rev. B. – 1999. – Vol. 59. – P. 3393–3407.Mishin, Y. Interatomic potentials for monoatomic metals from experimental data and ab initio calculations / Y. Mishin, D. Farkas // Phys. Rev. B. – 1999. – Vol. 59. – P. 3393–3407.Plimpton, S. Fast Parallel Algorithms for Short-Range Molecular Dynamics / S. Plimpton //Plimpton, S. Fast Parallel Algorithms for Short-Range Molecular Dynamics / S. Plimpton //Journal of Computational Physics. – 1995. – Vol. 117, № 1. – P. 1–19.Journal of Computational Physics. – 1995. – Vol. 117, № 1. – P. 1–19.Smith, W. Molecular dynamics on hypercube parallel computer / W. Smith // ComputerSmith, W. Molecular dynamics on hypercube parallel computer / W. Smith // ComputerPhysics Communications. – 1991. – Vol. 62. – P. 229–248.Physics Communications. – 1991. – Vol. 62. – P. 229–248.Рихтер, Дж. Windows для профессионалов: создание эффективных Win32-приложенийРихтер, Дж. Windows для профессионалов: создание эффективных Win32-приложенийс учетом специфики 64-разрядной версии Windows / Дж. Рихтер. – СПб. : Питер, 2001. – 752 с.с учетом специфики 64-разрядной версии Windows / Дж. Рихтер. – СПб. : Питер, 2001. – 752 с.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.