МОДЕЛИРОВАНИЕ ПРЕДПОЛИМЕРИЗАЦИОННОГО КОМПЛЕКСА ПОЛИМЕРОВ С МОЛЕКУЛЯРНЫМИ ОТПЕЧАТКАМИ ТРИ-О-АЦЕТИЛАДЕНОЗИНА

Аннотация

Рассматривается применение метода компьютерного моделирования QM/MM, совмещающе-го квантово-механический и молекулярно-механический подходы для моделирования предполимериза-ционных комплексов молекулы-темплата и мономеров и дальнейшего in-silica исследования биомоле-кулярных свойств полимеров с молекулярными отпечатками, что позволяет оценить их эффектив-ность и оптимизировать процесс получения и использования при различных условиях. Проводятся моделирование изолированных предполимеризационных комплексов темплата три-о-ацети-ладенозина с различным числом мономеров акриламида, метакриловой и мета-винил-бензойной ки-слот, а также сравнение результатов расчетов методом QM/MM и методом самосогласованного поля с точки зрения компьютерных затрат и параллелизации вычислений.