Лаборатория проблем защиты информации создана в 1996 г. Первым ее руководителем был В. В. Анищенко, с 2016 г. лабораторию возглавляет В. А. Дмитриев. Основными направлениями деятельности и областями научных исследований лаборатории являются:

– разработка теоретических основ методологии обеспечения защиты информации в информационных системах;

– разработка моделей, методов и средств для обоснования требований к информационным системам по информационной безопасности;

– разработка и формирование показателей и требований для национальных стандартов по оценке защищенности;

– разработка методик испытаний защищенных информационных систем;

– аттестация систем защиты информации в реальных условиях эксплуатации информационных систем;

– разработка методов обнаружения атак в информационно-телекоммуникационных системах.